После того как последнего Ангела удалось победить, организация NERV оказывается перед лицом новой, более угрожающей проблемы. В то время как Гэндо Икари активизирует свои планы по подготовке к Третьему удару, штаб-квартира NERV подвергается атаке боевиков из секретной организации Seele. Спокойствие и порядок, казавшиеся достигнутыми, быстро рушатся, оставляя в тени безысходности и ужасов. В это время Рэй Аянами, один из ключевых персонажей, совершает важный шаг, слившись с Лилит — таинственным существом, обладающим колоссальной силой. Данная трансформация становится катализатором судьбоносных событий, которые будут иметь колоссальные последствия для всего человечества. Тем временем на повестку дня выходит самый важный выбор для Синдзи Икари. Он оказывается в центре моральной дилеммы, представленной перед ним как возможность продолжения существования человечества или его полного уничтожения. Столкнувшись со своим внутренним миром, Синдзи погружается в бездну эмоций, страха и неопределенности. Решающий момент требует от него не только понимания себя, но и выбора, от которого будет зависеть будущее всей цивилизации. Воспоминания о своих друзьях и близких, страх перед изоляцией и понимание своих чувств будут бороться внутри него в это критическое время. В этой напряженной и многослойной narrative переплетаются элементы экшена, философии и психологической драмы. Конец Евангелиона задает важные вопросы о человеческой природе, существовании и взаимодействии между индивидуумом и обществом. Зрители чувствуют всю тяжесть выбора, который стоит перед Синдзи, и переживают вместе с ним многогранные эмоции, характеризующие его путь к самопознанию и принятию. В конечном итоге, фильм становится не только завершением истории, но и глубоким размышлением о том, что значит быть человеком в мире, полном неопределенности и страха.